Berdasarkan Peraturan Daerah Kabupaten Musi Banyuasin Nomor  9 Tahun 2025, tentang Pembentukan dan Susunan Perangkat Daerah Kabupaten  Musi Banyuasin, Struktur  Organisasi Badan Pengelola Pajak dan Retribusi Daerah Daerah Kabupaten Musi Banyuasin  sebagai berikut :

Susunan Organisasi Badan Pengelola Pajak dan Retribusi Daerah terdiri dari:

1.    Kepala Badan BAPENDA

2.    Sekretaris BAPENDA I.

a.    Subbagian Umum dan Kepegawaian;

b.    Kelompok Jabatan Fungsional.

3.   BAPENDA II 

    a. Bidang Pajak Bumi dan Bangunan (PBB) dan Bea Perolehan Hak Atas Tanah dan Bangunan (BPHTB)

4.    

5.      BAPENDA V Bidang Pegawasan,Pengembangan dan Pendapatan Transfer:

6.    BAPENDA II .Bidang Pajak Bumi dan Bangunan (PBB) dan Bea Perolehan Hak Atas Tanah dan Bangunan (BPHTB)

7.    Unit Pelaksana Teknis Badan; dan

8.    Kelompok Jabatan Fungsional.